墨卓單細胞ChIP測序

墨卓單細胞ChIP測序

一、產(chǎn)品介紹

本試劑盒通過抗體和 Tn5 酶識別蛋白與 DNA 的結(jié)合位點,并靶向切割 DNA 分子?；谝旱挝⒘骺丶夹g(shù)將經(jīng)過處理的單個細胞包裹形成油包水結(jié)構(gòu)，并借助帶有細胞標簽的微球捕獲 DNà 片段和標記 DNA 分子，實現(xiàn)蛋白與 DNA 位點結(jié)合的測序，具有高通量、超高分辨率、超強特異性的特點。目前提供的檢測抗體：可選5種組蛋白修飾：H3K27ac、H3K4me1、H3K4me3、H3K27me3、H3K36me3；1種DNA結(jié)合蛋白：Rpb1（RNA聚合酶 Ⅱ）


二、實驗流程


三、產(chǎn)品優(yōu)勢

1、數(shù)據(jù)可靠，質(zhì)量穩(wěn)定


· K562細胞樣本測試，抗體使用H3K27ac

· DNA片段捕獲水平可達2000+

2、技術(shù)前沿，性能出色


· 人PBMC樣本

· 抗體位點H3K4mel，H3K4me3，H3K27me3，H3K27ac

3、分群精準，相互映射


· 單細胞ChIP-seq能實現(xiàn)精準的分群

· 與 bulk ChlP-seq能相互印證與單細胞RNA-seq數(shù)據(jù)能完美映射




4、多種抗體，靈活選擇


· 已驗證6大常用抗體，可滿足70%研究需求：

· 5種組蛋白修飾：H3K27ac、H3K4me1、H3K4me3、H3K27me3、H3K36me3；

· 1種DNA結(jié)合蛋白：Rpb1（RNA聚合酶 Ⅱ）

· 個性定制

· 提供抗體驗證解決方案，可滿足個性化科研需求

四、應(yīng)用案例

1、利用單細胞ChIP-seq解析腫瘤耐藥機制

化療和靶向治療的耐藥性的出現(xiàn)是癌癥治療的一個主要挑戰(zhàn)，單細胞RNA-seq將細胞分為7類細胞亞群，發(fā)現(xiàn)非耐藥細胞中有一個細胞亞群具有耐藥潛能。單細胞ChIP-seq揭示H3K27me3的缺失導(dǎo)致耐藥性基因的激活并找出了耐藥性腫瘤細胞的發(fā)育進程。



Grosselin K, et al. Nat Genet.2019.


2、利用單細胞ChIP-seq解析腫瘤復(fù)發(fā)機制



數(shù)據(jù)表明樣本共分為4類細胞亞群，其中復(fù)發(fā)腫瘤細胞T1亞群占比最高，該群細胞H3K27me3的信號弱并且細胞干性相關(guān)的基因活躍，具有向其他細胞類群發(fā)育的潛力。



Steven J.Wu, et al.nature biotechnology.2021